Zur Gewährleistung eines sicheren Endproduktes richteten Molkereiunternehmen Qualitätssicherungssysteme ein. Diese können sie sich über die gesetzlichen Bestimmungen hinaus von Sachverständigenorganisationen nach international gültigen Normen (DIN/EU/ISO/IFS) zertifizieren lassen. Dabei greift man auf Elemente des HACCP-Konzeptes zurück (Hazard Analysis Critical Control Points). Betriebsspezifische Risikoanalysen ermöglichen es, gezielt potenzielle Schwachstellen im Produktionsablauf aufzuzeigen und Fehler zu vermeiden. Für Handel und Verbraucher bedeuten Qualitätssicherungssysteme ein hohes Maß an Produktsicherheit und qualitativ hochwertigen Erzeugnissen.